Honda Vario generasi pertama hadir pada Agustus 2006. Pada generasi awal tersebut, Honda Vario hanya tersedia dengan satu pilihan mesin. Mesin yang digunakan memiliki kapasitas silinder bersih sebesar 108 cc. Mesin ini menggunakan teknologi SOHC (Single Overhead Camshaft) yang memungkinkan penggunaan yang lebih efisien.
Detail spesifikasi mesin Honda Vario 2006:- Kapasitas Silinder: 108 cc- Konfigurasi Katup: SOHC (Single Overhead Camshaft)- Diameter x Langkah: 50 x 55 mm
Dengan mesin berkapasitas 108 cc ini, Honda Vario mampu memberikan performa yang cukup baik untuk kebutuhan sehari-hari, baik dalam berkendara di perkotaan maupun perjalanan jarak jauh. Mesin ini dikenal cukup handal dan memiliki reputasi yang baik dalam hal daya tahan dan efisiensi bahan bakar.
Dengan demikian, Honda Vario 2006 menggunakan mesin berkapasitas 108 cc yang dapat diandalkan untuk kebutuhan berkendara sehari-hari.