Sama seperti model Vario 125 terdahulu, Honda Vario 150 masih mengandalkan rem cakram pada roda depan dan tromol di bagian belakang. Rem cakram pada roda depan memberikan keunggulan dalam daya cengkram yang lebih baik dan responsif, sehingga memungkinkan pengendara untuk mengendalikan laju kendaraan dengan lebih baik terutama dalam kondisi darurat. Sedangkan tromol di bagian belakang memberikan kestabilan dan keamanan saat melakukan pengereman.
Dengan sistem pengereman yang menggunakan rem cakram dan tromol ini, Honda Vario 150 dapat memberikan kinerja pengereman yang handal dan responsif baik pada kecepatan rendah maupun tinggi. Hal ini membuat pengendara merasa lebih aman dan percaya diri saat berkendara dengan Vario 150.