Honda Vario 125 NEW menggunakan bahan bakar dengan nilai RON (Research Octane Number) tertentu sesuai dengan rasio kompresi mesinnya. Berdasarkan informasi resmi dari Honda, rasio kompresi pada Honda Vario 125 adalah 11:1. Oleh karena itu, motor ini memerlukan bahan bakar dengan nilai oktan antara 92 hingga 95. Bahan bakar yang sesuai untuk digunakan pada Honda Vario 125 NEW termasuk bensin dengan RON 95, Super, Pertamax, dan Performance 92.
Dengan demikian, Honda Vario 125 NEW sebaiknya menggunakan bahan bakar dengan RON 95 atau jenis bahan bakar lain yang memiliki oktan dalam rentang yang disarankan oleh Honda untuk menjaga kinerja mesin dan mencegah terjadinya knocking selama penggunaan. Pemilihan bahan bakar yang sesuai akan membantu menjaga performa mesin serta memperpanjang umur mesin pada Honda Vario 125 NEW.