Honda Vario 125 menggunakan bahan bakar dengan nilai oktan antara 92 hingga 95. Hal ini disesuaikan dengan rasio kompresi pada Honda Vario 125 yang sebesar 11:1. Bahan bakar yang sesuai untuk digunakan pada motor ini antara lain:- Bensin dengan RON 95- Bensin jenis Super- Pertamax- Performance 92
Dengan menggunakan bahan bakar yang sesuai, performa mesin Honda Vario 125 dapat optimal dan efisiensi bahan bakar dapat terjaga dengan baik. Sebaiknya hindari penggunaan bahan bakar dengan nilai oktan di bawah 92, karena hal ini dapat memengaruhi kinerja mesin dan menyebabkan kerusakan pada motor dalam jangka panjang.