Honda Vario 125 CBS ISS menggunakan rangka underbone. Rangka underbone merupakan rangka motor yang biasanya digunakan pada skuter matik, seperti Honda Vario. Rangka ini didesain untuk memberikan stabilitas dan kenyamanan saat berkendara, serta memudahkan pengendara dalam manuver di tengah kemacetan perkotaan. Rangka underbone juga memberikan kesan sporty pada tampilan motor skuter matik seperti Honda Vario 125 CBS ISS.
Rangka underbone memiliki ciri khas yaitu rangka bagian bawah yang mengelilingi mesin motor, sehingga memberikan kesan kompak dan aerodinamis. Rangka ini juga memberikan kestabilan saat berkendara pada kecepatan tinggi maupun rendah. Dengan menggunakan rangka underbone, Honda Vario 125 CBS ISS dapat memberikan pengalaman berkendara yang nyaman dan aman bagi penggunanya.