Mesin Vario 125 New memiliki rasio kompresi yang sama dengan generasi sebelumnya, yaitu 11:1. Rasio kompresi mengacu pada perbandingan volume maksimum saat langkah kompresi (volume terkecil) dengan volume minimum saat langkah ekspansi (volume terbesar) dalam silinder mesin.
Rasio kompresi yang tinggi biasanya menghasilkan efisiensi termal yang lebih baik, karena tekanan yang lebih tinggi pada langkah kompresi menghasilkan pembakaran yang lebih efisien dan lebih banyak tenaga. Namun, rasio kompresi yang terlalu tinggi juga dapat menyebabkan masalah seperti knocking (ketukan mesin) atau knocking (denting) pada piston, yang dapat merusak mesin.
Dalam hal penggunaan bahan bakar, mesin Vario 125 New masih dapat menggunakan bensin dengan oktan RON 88, seperti yang dijelaskan oleh Endro Sutarno, Technical Service Division PT. Astra Honda Motor. Mesin dengan kompresi 11:1 umumnya memerlukan bahan bakar dengan oktan yang cukup tinggi untuk mencegah knocking. Namun, bensin RON 88 masih dapat digunakan dengan baik pada mesin ini.
Penting untuk mengikuti rekomendasi pabrikan dalam penggunaan bahan bakar, karena penggunaan bahan bakar dengan oktan yang lebih rendah atau lebih tinggi dari rekomendasi dapat mempengaruhi kinerja mesin dan bahkan merusak mesin dalam jangka panjang.