Kapasitas tangki pada New Honda Vario 125 adalah sebesar 5,5 liter. Hal ini berarti tangki Vario 125 New bisa menampung bahan bakar sebanyak 5,5 liter saat diisi penuh.
Dengan kapasitas tangki sebesar ini, pengguna Vario 125 New dapat menjelajahi jarak yang cukup jauh sebelum perlu mengisi ulang bahan bakar.