Vario 125 LED memiliki mesin yang sama dengan Vario 125 standar, yaitu mesin Pendingin Cairan PGM-FI 124.8 cc 1 Cylinder. Mesin ini mampu menghasilkan Tenaga sebesar 11.1 hp pada 8500 rpm dan Torsi sebesar 10.8 Nm pada 5000 rpm. Dengan demikian, Vario 125 LED memiliki tenaga sebesar 11.1 hp. Mesin yang digunakan pada Vario 125 LED ini dikembangkan untuk memberikan performa yang handal dan efisien dalam penggunaan sehari-hari. Mesin PGM-FI pada Vario 125 LED juga dikenal cukup responsif dan dapat memberikan akselerasi yang baik dalam berbagai kondisi.
Selain itu, Vario 125 LED juga memiliki ketinggian kursi 769 mm, yang membuatnya nyaman digunakan untuk berbagai keperluan sehari-hari. Dengan kombinasi antara performa mesin yang handal dan desain yang ergonomis, Vario 125 LED menjadi pilihan yang populer di kalangan pengguna skutik di Indonesia.