Vario 125 2023 belum dilengkapi dengan fitur kunci keyless. Meskipun telah dilengkapi dengan Smart Key yang dilengkapi dengan Alarm, namun skutik ini masih menggunakan kunci magnetik sebagai sistem kunci utamanya. Meskipun kunci magnetik ini sudah menghadirkan kemudahan, namun tidak seaman dan sepraktis fitur kunci keyless yang biasanya memungkinkan pengendara untuk membuka dan menyalakan sepeda motor tanpa harus menyentuh kunci fisik sama sekali.
Dengan belum adanya fitur kunci keyless pada Vario 125 2023, pengguna harus tetap memastikan untuk merawat dan menjaga kunci magnetik dengan baik agar tidak terjadi kerusakan atau kehilangan kunci yang dapat menyulitkan pengguna dalam mengakses sepeda motor. Meskipun begitu, Honda terus melakukan inovasi dan peningkatan fitur pada setiap model skutik mereka, sehingga tidak menutup kemungkinan adanya penambahan fitur kunci keyless pada model Vario di masa mendatang.