Motor Vario 125 dan Vario 150 memiliki perbedaan utama dalam hal mesin dan tenaga yang dihasilkan. Vario 125 menggunakan mesin dengan kapasitas 125 cc, sementara Vario 150 menggunakan mesin dengan kapasitas 150 cc. Perbedaan ini mengakibatkan perbedaan tenaga yang dihasilkan oleh masing-masing motor.
Vario 125 memiliki tenaga sebesar 8,3 kW pada 8500 rpm. Sementara itu, Vario 150 memiliki tenaga sebesar 9,7 kW pada 8500 rpm. Dengan demikian, Vario 150 memiliki tenaga yang lebih besar dibandingkan dengan Vario 125. Perbedaan ini dapat dirasakan saat berkendara, di mana Vario 150 memiliki akselerasi yang lebih baik dan mampu melewati tanjakan dengan lebih mudah dibandingkan dengan Vario 125.